Tag: arginina cancro

Codoni e residui di arginina vengono spesso persi e sono associati a un aumento dell'espressione di ASS1. (A) Heatmap raffigurante codoni guadagnati (rossi) e persi (blu) attraverso il TCGA. I guadagni e le perdite sono normalizzati al numero totale di eventi di mutazione missenso e silente per campione per ogni tipo di cancro. (B) Diagramma di corda qualitativo che mostra gli eventi di commutazione degli aminoacidi nel cancro dopo l'aggiustamento dalle simulazioni. I nastri che toccano direttamente un segmento di colonna indicano la perdita di quello specifico codone dell'amminoacido durante un evento mutazionale e l'acquisizione del corrispondente codone dell'amminoacido in cui termina il nastro. I nastri che iniziano e finiscono nello stesso amminoacido rappresentano mutazioni sinonime. (C) Eventi di commutazione del codone dell'arginina osservati rispetto al previsto. I cluster sono stati assegnati con Affinity Propagation. ( D ) Espressione di ASS1 in campioni di carcinoma colorettale (CRC) con eventi di commutazione del codone dell'arginina di alto o basso grado (n = 96 per gruppo) con baffi che indicano i valori minimo e massimo. (DESeq2, ****P aggiustato è inferiore a 0,0001).